schrodinger.protein package

Protein related modules, including functionality for analysis and manipulation.

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Subpackages

• schrodinger.protein.gpcr package
  • Submodules
    • schrodinger.protein.gpcr.annotate module
    • schrodinger.protein.gpcr.gpcrdb module
    • schrodinger.protein.gpcr.sql module
    • schrodinger.protein.gpcr.tasks module
    • schrodinger.protein.gpcr.update_gpcr_db module
• schrodinger.protein.helm package
  • Submodules
    • schrodinger.protein.helm.helm_renderer module
    • schrodinger.protein.helm.image_generation module
• schrodinger.protein.protassign namespace
  • Submodules
    • schrodinger.protein.protassign.changeables module
    • schrodinger.protein.protassign.constants module
    • schrodinger.protein.protassign.hbond_cluster module
    • schrodinger.protein.protassign.network_solver module
    • schrodinger.protein.protassign.pka_prediction module
    • schrodinger.protein.protassign.unsatisfied_donors module
    • schrodinger.protein.protassign.utils module
• schrodinger.protein.tasks namespace
  • Submodules
    • schrodinger.protein.tasks.binding_site_align module
    • schrodinger.protein.tasks.blast module
    • schrodinger.protein.tasks.clustal module
    • schrodinger.protein.tasks.descriptors module
    • schrodinger.protein.tasks.hit_align module
    • schrodinger.protein.tasks.kinase module
    • schrodinger.protein.tasks.mock_blast_output module
    • schrodinger.protein.tasks.muscle module
    • schrodinger.protein.tasks.optimize_alignment module
    • schrodinger.protein.tasks.pfam module
    • schrodinger.protein.tasks.sta module
    • schrodinger.protein.tasks.structure_alignment module

Submodules

• schrodinger.protein.align module
• schrodinger.protein.alignment module
• schrodinger.protein.analysis module
• schrodinger.protein.analysis_params module
• schrodinger.protein.annotation module
• schrodinger.protein.assignment module
• schrodinger.protein.biounit module
• schrodinger.protein.buildpeptide module
• schrodinger.protein.captermini module
• schrodinger.protein.constants module
• schrodinger.protein.findhets module
• schrodinger.protein.getpdb module
• schrodinger.protein.getpdb_utility module
• schrodinger.protein.helix module
• schrodinger.protein.membrane module
• schrodinger.protein.natural_analog module
• schrodinger.protein.nonstandard_residues module
• schrodinger.protein.pdbname module
• schrodinger.protein.predictors module
• schrodinger.protein.process_enamine_db module
• schrodinger.protein.properties module
• schrodinger.protein.reliability module
• schrodinger.protein.remediate module
• schrodinger.protein.renumber_residues module
• schrodinger.protein.residue module
• schrodinger.protein.rotamers module
• schrodinger.protein.seqres module
• schrodinger.protein.sequence module